در سال 2007 حدود 4،350 مدرسه در استانبول وجود داشتند كه بيشتر آن ها را مدارس ابتدايي تشكيل مي دادند. به طور متوسط هر مدرسه 688 دانش آموز داشت.

در سال هاي اخير سيستم آموزشي استانبول رشد زيادي پيدا كرده است. از سال  2000 تا 2007 تعداد مدارس و معلم هاي شهر استانبول دو برابر شده است و تعداد دانش آموزان نيز 60% افزايش يافته است. دبيرستان گاتالاساراي (به تركي استانبولي Galatasaray Lisesi) در سال 1481 ميلادي با نام مدرسه سلطنتي قصر گاتالا  بنيان نهاده شد و قديمي ترين دبيرستان شهر و پس از دانشگاه استانبول قديمي ترين مركز آموزشي استانبول است. اين دبيرستان با دستور سلطان بايزيد دوم ساخته شد و هدف آن گرد آوري دانش آموزان با پيشينه هاي تحصيلي متفاوت براي گسترش دامنه امپراتوري بود. اين دبيرستان يكي از دبيرستان هاي آناتولي تركيه به شمار مي رود. دبيرستان هاي آناتولي تركيه دبيرستان هايي هستند كه روي تحصيل زبان هاي  خارجي تمركز بيشتري دارند. به عنوان مثال دبيرستان گالاتاسراي تحصيل به زبان فرانسه را ارائه مي كند در حالي كه زبان آموزشي ديگر دبيرستان هاي تركيه انگليسي يا آلماني را به همراه تركي استانبولي تدريس مي كنند. شهر استانبول از وجود دبيرستان هاي خارجي مانند Liceo Italiano متعلق به قرن نوزدهم نيز بهره مي برد. از دانشگاه هاي معروف استانبول مي توان دانشگاه استانبول ، دانشگاه فني استانبول ، دانشگاه بغازيچي ، دانشگاه هنرهاي زيباي معمار سينان دانشگاه مرمره و دانشگاه مدنيت استانبول را نام برد.